Лаборатория статистической мультиомики и биоинформатики

Уфимский федеральный исследовательский центр РАН - (УФИЦ РАН)

Новости

X Международная научная конференцияa month ago

Международная конференция ITIDS'2024 (12-14 ноября 2024 г.), посвященная информационным технологиям, искусственному интеллекту и...

Cотрудничество Института биохимии и генетики УФИЦ РАН и ООО «Биотехнологический кампус»5 months ago

В рамках сотрудничества Института биохимии и генетики УФИЦ РАН с ООО «Биотехнологический кампус» в лаборатории проводится биоинформатический анализ...

Основные результаты по итогам реализации проекта за 2021 - 2023 гг5 months ago

Усовершенствованы подходы и разработаны высокопроизводительные инструменты для импутации пропущенных...

Школа семинар “Применение современных методов биоинформатического анализа”a year ago

27 ноября прошла школа-семинар молодых учёных

Научный семинар “Скрытые состояния клетки по данным транскриптомики одиночных клеток”a year ago

4 июля прошел семинар на котором был заслушан доклад Всеволода Юрьевича Макеева

Научный семинар “Исследование молекулярно-генетических основ наследственного и спорадического рака яичников”a year ago

6 июня прошел научный семинар – “Исследование молекулярно-генетических основ наследственного и спорадического рака яичников”

Научный семинар “Индивидуальные варианты в регуляторных областях геномов при полногеномном анализе ассоциаций”a year ago

6 апреля прошел научный семинар “Индивидуальные варианты в регуляторных областях геномов при полногеномном анализе ассоциаций” в рамках которого выступил Макеев Всеволод Юрьевич

I Всероссийская конференция с международным участием «ПЕРСОНАЛИЗИРОВАННАЯ МЕДИЦИНА И СОВРЕМЕННЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ТЕХНОЛОГИИ»9 months ago

Конференция проводилась в рамках Мегагранта Правительства Российской Федерации «Разработка высокопроизводительных вычислительных инструментов для комплексного анализа мультиомиксных данных и развития персонализированной медицины» (соглашение № 075-15-2021-595 от «2» июня 2021 г.), реализуемого в Институте биохимии и генетики Уфимского федерального центра РАН.

Лаборатория в числах

Сотрудников

33

Публикации

53

Диссертаций

10

Объектов ИС

15

Наша цель

Решение проблемы эффективного использования больших данных путём разработки подходов к импутации и анализу омиксных данных и внедрения инновационной высокопроизводительной инфраструктуры для уже созданных и новых аналитических инструментов.

  • Усовершенствовать подходы и разработать высокопроизводительные инструменты для анализа множественных фенотипов на индивидуальном уровне и уровне сводных статистических данных полногеномных ассоциативных исследований, включив их в платформу ANTEOMICS и способствуя эффективному использованию крупномасштабных многокомпонентных данных.
  • Систематизировать существующую в Институте биохимии и генетики Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук (ИБГ УФИЦ РАН) коллекцию биологических материалов человека.
  • Внедрить инструменты и подходы к сбору данных в режиме онлайн и создать выборку для проведения лонгитюдных исследований по многофакторным признакам и болезням, в том числе исследование генетических основ формирования спортивных характеристик и физической активности с использованием выборки из числа студентов, проходящих обучение на базовых кафедрах ИБГ УФИЦ РАН, в том числе Башкирского государственного университета, Башкирского государственного медицинского университета и Башкирского государственного нефтяного технического университета.
  • Создать новый мощный кластер для высокопроизводительных вычислений (HPC) в ИБГ УФИЦ РАН (до 200 пользователей с низким средним объемом и до 20 пользователей с большим объемом).
  • Разработать новые подходы персонализированной медицины для прогнозирования индивидуального риска с использованием полигенных оценок риска (PRS – polygenic risk scores).
  • Способствовать привлечению в науку талантливых молодых исследователей, получению ими опыта работы в конкурентоспособных проектах и подтверждению ими квалификации путем подготовки и защиты диссертаций.

Результаты

Лаборатория статистической мультиомики и биоинформатики располагается на базе института биохимии и генетики.

Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук

Юридический адрес: проспект Октября, 71, г. Уфа, Республика Башкортостан, Российская Федерация, 450054

тел./факс: +7 347 235-60-88, e-mail: [email protected]

2021-2024