Лаборатория статистической мультиомики и биоинформатики
Уфимский федеральный исследовательский центр РАН - (УФИЦ РАН)
2024
Enhancing SNV identification in whole-genome sequencing data through the incorporation of known genetic variants into the minimap2 index
Авторы Guguchkin Egor, Kasianov Artem, Belenikin Maksim, Zobkova Gaukhar, Kosova Ekaterina, Makeev Vsevolod, Karpulevich Evgeny. DOI: 10.1186/s12859-024-05862-y
2023
FANCAM missense variants and breast cancer risk: a case-control association study of 75,156 European women
Авторы: Figlioli G, Billaud A, Ahearn TU, …, Bermisheva M, … Khusnutdinova EK, et al. doi: doi: 10.1038/s41431-022-01257-w Q1
The potential of miR-153 as aggressive prostate cancer biomarkers
Авторы: Gilyazova I., Ivanova E., Sinelnikov M., Pavlov V.N., Khusnutdinova E., Gareev I., Beilerli A., Mikhaleva L., Liang Ya. doi: 10.1016/j.ncrna.2022.10.002 Q1
Exosomal MicroRNA Levels Associated with Immune Checkpoint Inhibitor Therapy in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
Авторы: Elizaveta Ivanova, Dilara Asadullina, Gulshat Gilyazova, Radmir Rakhimov, Adel Izmailov, Valentin Pavlov, Elza Khusnutdinova, AndIrina Gilyazova doi: 10.3390/Biomedicines11030801 Q2
Host Genetic Variants Linked to COVID-19 Neurological Complications and Susceptibility in Young Adults-A Preliminary Analysis
Авторы: Anastasiya Kazantseva, Renata Enikeeva, Zalina Takhirova, Yuliya Davydova, Rustam Mustafin, Sergey Malykh, Alexandra Karunas, Alexander Kanapin, Elza Khusnutdinova doi: 10.3390/jpm13010123 Q2
Aggregation tests identify new gene associations with breast cancer in populations with diverse ancestry
Авторы: Mueller SH, Lai AG, Valkovskaya M, …, Bermisheva M, …, Khusnutdinova EK, et al. doi: 10.1186/s13073-022-01152-5 Q1
Perspective for studying the relationship of miRNAs with transposable elements
Авторы: Mustafin R.N., Khusnutdinova E.K. doi: 10.3390/cimb45040204 Q2
Targeted next-generation sequencing of 21 candidate genes in hereditary ovarian cancer patients from the Republic of Bashkortostan
Авторы: Prokofyeva DS, Mingazheva ET, Valova YV, Sakaeva DD, Faishanova RR, Nurgalieva AK, Valiev RR, Bogdanova N, Dörk T, Khusnutdinova EK. doi: 10.1186/s13048-023-01119-z Q1
Integrating Common Risk Factors with Polygenic Scores Improves the Prediction of Type 2 Diabetes
Авторы: Timasheva Y, Balkhiyarova Z, Avzaletdinova D, Rassoleeva I, Morugova TV, Korytina G, Prokopenko I, Kochetova O. doi: 10.3390/ijms24020984 Q1
Относительная длина теломерных повторов у лиц с хроническим алкоголизмом в зависимости от клинико-анамнестических характеристик
Авторы: КАЗАНЦЕВА А.В., ДАВЫДОВА Ю.Д., ФАСХУТДИНОВА Г.Г., ЕНИКЕЕВА Р.Ф., ФЕДОРОВА Ю.Ю., ГАРЕЕВА А.Э., АСАДУЛЛИН А.Р., МИХАЙЛОВА А.В., ВАЛИНУРОВ Р.Г., ХУСНУТДИНОВА Э.К. doi: 10.25789/YMJ.2023.81.01 Q4
Полигенный анализ полиморфных локусов генов цитокинов и иммунного ответа при хронической обструктивной болезни легких
Авторы: Корытина Г.Ф., Азнабаева Ю.Г., Кочетова О.В., Насибуллин Т.Р., Ахмадишина Л.З., Хуснутдинова Н.Н., Загидуллин Н.Ш., Викторова Т. В. doi: 10.31857/S0016675823020042 Q4
Анализ ассоциаций полиморфных вариантов генов ALDH7A1, AOC1, PSP, ADCYAP1, участвующих в метаболизме гистамина, с развитием бронхиальной астмы у индивидов из Республики Башкортостан
Авторы: Савельева О.Н., Карунас А.С., Федорова Ю.Ю., Власова А.О., Бикташева А.Р., Гатиятуллин Р.Ф., Эткина Э.И., Хуснутдинова Э.К… doi: 10.25789/YMJ.2023.81.02 Q4
A combined effect of polygenic scores and environmental factors on individual differences in depression level
Авторы: Kazantseva A., Davydova Y., Enikeeva R., Mustafin R., Malykh S., Lobaskova M., Kanapin A., Prokopenko I., Khusnutdinova E. doi: 10.3390/genes14071355 Q2
Study of The Molecular Nature of Congenital Cataracts in Patients from The Volga–Ural Region
Авторы: Khidiyatova I.M., Khidiyatova I.I. , Zinchenko R. A., Marakhonov A.V., Karunas A.S., Avkhadiev S.R., Aznabaev M.T., Khusnutdinova E.K. doi: 10.3390/cimb45060327 Q2
MiRNA-146a—A Key Player in Immunity and Diseases
Авторы: Gilyazova I , Asadullina D, Kagirova E, Sikka R, Mustafin A, Ivanova E, Bakhtiyarova K, Gilyazova G, Gupta S, Khusnutdinova E, Gupta H and Pavlov V. doi: 10.3390/ijms241612767 Q1
Рассеянный склероз в Республике Башкортостан: популяционно-специфические генетические предикторы и результаты 20-летнего клинического наблюдения
Авторы: Тимашева Я.Р., Насибуллин Т.Р., Туктарова И.А., Эрдман В.В., Галиуллин Т.Р., Лютов О.В., Бахтиярова К.З. doi: 10.17116/jnevro202312307234
Distribution of Polymorphic Gene Variants Associated with the Severe Course of COVID-19 in the Subpopulation of Bashkirs
Авторы: Ekomasova N.V., Dzhaubermezov M.A., Gabidullina L.R., Sufianova Z.R., Galimova Y.O., Kazantseva A.V., Nurgalieva A.Kh., Prokofieva D.S., Khusnutdinova E.K. doi: 10.24412/2500-2295-2023-1-5-16 Q4
РЕПЛИКАТИВНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ АССОЦИАЦИИ GWAS-ЗНАЧИМЫХ ПОЛИМОРФНЫХ ЛОКУСОВ ГЕНОВ TUFM, SH2B1, ZNF638, NEGR1, ATP2A1, EXOC4, CSE1L С КОГНИТИВНЫМИ СПОСОБНОСТЯМИ
Авторы: doi: 10.31857/S0016675823090060 Q4
Antisocial behavior: nature vs. nurture
Авторы: Kazantseva A., Yakovleva D., Davydova Y., Kosareva A., Valinurov R., Khusnutdinova E. doi: 10.24412/2500-2295-2023-3-83-94 Q4
Эпигенетическая регуляция ремоделирования костной ткани и ее роль в патогенезе первичного остеопороза
Авторы: Ялаев Б.И., Хусаинова Р.И. doi: 10.18699/VJGB-23-48 Q3
HOCOMOCO in 2024: a rebuild of the curated collection of binding models for human and mouse transcription factors
Авторы: Vorontsov IE, Eliseeva IA, Zinkevich A, Nikonov M, Abramov S, Boytsov A, Kamenets V, Kasianova A, Kolmykov S, Yevshin IS, Favorov A, Medvedeva YA, Jolma A, Kolpakov F, Makeev VJ, Kulakovskiy IV. doi: 10.1093/nar/gkad1077 Q1
РОЛЬ МЕТИЛИРОВАНИЯ ДНК ПРИ РАКЕ ЛЕГКОГО (ОБЗОР)
Авторы: Низамова А. Р., Гималова Г. Ф., Хуснутдинова Э. К. doi: 10.18413/2658-6533-2023-9-3-0-1
miRNA Expression Patterns in Early- and Late-Stage Prostate Cancer Patients: High-Throughput Analysis
Авторы: Gilyazova I, Ivanova E, Gupta H, Mustafin A, Ishemgulov R, Izmailov A, Gilyazova G, Pudova E, Pavlov V, Khusnutdinova E. doi: 10.3390/biomedicines11113073 Q2
Individual variance in human aggression: a combined effect of polygenic score and social/lifestyle factors
Авторы: Kazantseva A. V., Davydova Yu. D., Enikeeva R. F., Yakovleva D. V., Mustafin R. N., Lobaskova M. M., Malykh S. B., and Khusnutdinova E. K. doi: 10.1134/S1022795423140065 Q4
Spectrum and Frequency of Germline FANCM Protein-Truncating Variants in 44,803 European Female Breast Cancer Cases
Авторы: Figlioli G, Billaud A, Wang Q,… Bermisheva M., Khusnutdinova E. K. et al. doi: 10. 3390/cancers15133313 Q1
Evaluation of European-based polygenic risk score for breast cancer in Ashkenazi Jewish women in Israel
Авторы: Levi H, Carmi S, Rosset S, … Bermisheva M., Khusnutdinova E. K. et al. doi: 10.1136/jmg-2023-109185 Q1
2022
Relationship between glucose homeostasis and obesity in early life — a study of Italian children and adolescents
Balkhiyarova Z, Luciano R, Kaakinen M, Ulrich A, Shmeliov A, Bianchi M, Chioma L, Dallapiccola B, Prokopenko I, Manco M. Q1
Breast cancer risks associated with missense variants in breast cancer susceptibility genes
Dorling L, Carvalho S, Allen J, ... Bermisheva M, Khusnutdinova. doi: 10.1186/s13073-022-01052-8. Q1
Pathology of tumors associated with pathogenic germline variants in 9 breast cancer susceptibility genes
Mavaddat N, Dorling L, Carvalho S, …, Bermisheva M, …, Khusnutdinova E, …, Easton DF. doi: 10.1001/jamaoncol.2021.6744. Q1
Multilocus evaluation of genetic predictors of multiple sclerosis
Timasheva Y, Nasibullin TR, Tuktarova IA, Erdman VV, Galiullin TR, Zaplakhova OV, Bakhtiiarova KZ. Q2
Роль генов воспалительного ответа организма в формировании индивидуальных различий в уровне невербального интеллекта
Еникеева Р.Ф., Казанцева А.В., Давыдова Ю.Д., Мустафин Р.Н., Тахирова З.Р., Малых С.Б., Ковас Ю.В., Хуснутдинова Э.К. Q3
The relationship between chemokine and chemokine receptor genes polymorphisms and chronic obstructive pulmonary disease susceptibility in Tatar population from Russia: а case control study
Korytina G. F., Aznabaeva Y.G , Akhmadishina L.Z., Kochetova O.V., Nasibullin T.R., Zagidullin N. Sh., Zagidullin Sh. Z., Viktorova T.V. doi: 10.1007/s10528-021-10087-2. Q3
Gene-gene and gene-environment interactions of the inflammatory gene variants in the development of chronic obstructive pulmonary disease
Korytina G. F., Aznabaeva Y.G., Nasibullin T. R., Kochetova O.V., Khusnutdinova N. N., Viktorova T.V., Zagidullin N.Sh. doi: 10.36922/gtm.v1i1.91
Индивидуальные различия числа копий митохондриальной ДНК: роль социально-демографических параметров
Еникеева Р. Ф., Казанцева А. В., Давыдова Ю. Д., Мустафин Р. Н., Лобаскова М. М., Малых С. Б., Ковас Ю.В., Хуснутдинова Э. К. Q4
Using a Polygenic Score to Predict the Risk of Developing Primary Osteoporosis
Yalaev B, Tyurin A, Prokopenko I, Karunas A, Khusnutdinova E, Khusainova R. doi: 10.3390/ijms231710021. Q1
MicroRNA Processing Pathway-Based Polygenic Score for Clear Cell Renal Cell Carcinoma in the Volga-Ural Region Populations of Eurasian Continent
Ivanova E., Gilyazova I., Pavlov V., Izmailov A., Gimalova G., Karunas A., Prokopenko I., Khusnutdinova E. doi: 10.3390/genes13071281. Q2
Exosomal miRNA-146a is downregulated in clear cell renal cell carcinoma patients with severe immune-related adverse events
Ivanova E., Asadullina D., Rakhimov R., Izmailov A., Izmailov Al., Gilyazova G., Galimov Sh., Pavlov V., Khusnutdinova E., Gilyazova I. doi:10.1016/j.ncrna.2022.06.004. Q2
Association of inflammation gene polymorphism with increased risk of metabolic syndrome in tatar ethnic group
Kochetova O.V., Avzaletdinova O.V., Korytina O.V. doi: 10.15275/rusomj.2022.0305
Ассоциация вариантов генов LEP rs2167270, LEPR rs1137100, GHRL rs696217, rs27647 и NPY rs16147 с ожирением и пищевым поведением подростков: исследование «случай-контроль»
Кочетова, О. В., Шангареева, З. А., Викторова, Т. В., Корытина, Г. Ф., Викторов, В. В.
Анализ мутаций гена ATL1 и клинических особенностей течения заболевания у пациентов с наследственной спастической параплегией
Хидиятова И.М., Сайфуллина Е.В., Карунас А.С., Ахметгалеева А.Ф., Кутлубаева Р.Ф., Смакова Л.А., Лобов С.Л., Поляков А.В., Щагина О.А., Кадникова В.А., Рыжкова О.П., Магжанов Р.В., Хуснутдинова Э.К. Q4
The potential of miR-153 as aggressive prostate cancer biomarker
Gilyazova I, Ivanova E, Sinelnikov M, Pavlov V, Khusnutdinova E, Gareev I, Beilerli A, Mikhaleva L, Liang Y. doi: 10.1016/j.ncrna.2022.10.002. Q2
Alu Deletions in LAMA2 and CDH4 Genes Are Key Components of Polygenic Predictors of Longevity
Erdman, Vera V., Denis D. Karimov, Ilsia A. Tuktarova, Yanina R. Timasheva, Timur R. Nasibullin, and Gulnaz F. Korytina. doi: 10.3390/ijms232113492. Q1
Роль полиморфных вариантов генов-компонентов сигнального пути PTEN/PI3K/AKT в развитии рака предстательной железы
Гилязова И.Р., Иванова Е.А., Бермишева М.А., Логинова М.В., Асадуллина Д.Д., Ишемгулов Р.Р., Мустафин А.Т., Павлов В.Н., Хуснутдинова Э.К. doi: 10.31857/S0016675822070050. Q4
Индивидуальные вариации длины теломер у здоровых индивидов: эффект полиморфного варианта гена TERT и урбанизации
Казанцева, А.В., Давыдова, Ю.Д., Еникеева, Р.Ф., Мустафин, Р.Н., Лобаскова, М.М., Малых, С.Б., Хуснутдинова, Э.К. doi: 10.31857/S0016675822090107. Q4
Мультиомиксные подходы к поиску молекулярно-генетических предикторов остеопороза
Ялаев Б.И., Тюрин А.В., Хусаинова Р.И. doi: 10.23868/202205002
Полигенный анализ наследственной предрасположенности к эссенциальной гипертензии
Тимашева ЯР, Герасимова КА, Туктарова ИА, Эрдман ВВ, Насибуллин ТР. doi:10.18705/1607-419X-2022-28-1-33-45
Genetic Polymorphisms of Cytochromes P450 in Finno-Permic Populations of Russia. Genes
Dzhaubermezov M, Ekomasova N, Mustafin R, Gabidullina L, Galimova Y, Nurgalieva A, Valova Y, Prokofyeva D, Khusnutdinova E. Q2
2021
Germline variants and breast cancer survival in patients with distant metastases at primary breast cancer diagnosis
Maria Escala-Garcia, Sander Canisius, Renske Keeman, Taru A. Muranen, Heli Nevanlinna doi: 10.1038/s41598-021-99409-3
The role of the KIBRA and APOE genes in developing spatial abilities in humans
Казанцева, А. В., Еникеева, Р. Ф., Давыдова, Ю. Д., Мустафин, Р. Н., Тахирова, З. Р., Малых, С. Б., Лобаскова, М. М., Тихомирова, Т. Н., Хуснутдинова, Э. К. doi: 10.18699/VJ21.097
Methylation and expression levels of microRNA-23b/-24-1/-27b, microRNA-30c-1/-30e, microRNA-301a and let-7g are dysregulated in clear cell renal cell carcinoma
I. Gilyazova, E. Ivanova, G. Gilyazova, I. Sultanov, A. Izmailov, R. Safiullin, V. Pavlov & E. Khusnutdinova doi: 10.1007/s11033-021-06573-w
The Relationship Between Chemokine and Chemokine Receptor Genes Polymorphisms and Chronic Obstructive Pulmonary Disease Susceptibility in Tatar Population from Russia: A Case Control Study
Gulnaz F. Korytina, Yulia G. Aznabaeva, Leysan Z. Akhmadishina, Olga V. Kochetova, Timur R. Nasibullin, Naufal Sh. Zagidullin, Shamil Z. Zagidullin & Tatyana V. Viktorova doi: 10.1007/s10528-021-10087-2
Genetic predictors of sick sinus syndrome
Yanina Timasheva, Marat Badykov, Leysan Akhmadishina, Timur Nasibullin, Elena Badykova, Alfiya Pushkareva, Vladimir Plechev, Ildus Sagitov & Naufal Zagidullin doi: 10.1007/s11033-021-06517-4
ВКЛАД ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ IL12A, IL12B, IL13 ИIL12RB2 В РАЗВИТИЕ ХРОНИЧЕСКОЙ ОБСТРУКТИВНОЙ БОЛЕЗНИ ЛЕГКИХ В ЭТНИЧЕСКОЙ ГРУППЕ ТАТАР
КОРЫТИНА Г.Ф., ЗУЛКАРНЕЕВ Ш.Р., АЗНАБАЕВА Ю.Г., КОЧЕТОВА О.В., ХУСНУТДИНОВА Н.Н., АХМЕТКИРЕЕВА Т.Т.М., ЗАГИДУЛЛИН Н.Ш., ВИКТОРОВА Т.В. doi: 10.25789/YMJ.2021.75.05
Лаборатория статистической мультиомики и биоинформатики располагается на базе института биохимии и генетики.
Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук
Юридический адрес: проспект Октября, 71, г. Уфа, Республика Башкортостан, Российская Федерация, 450054
тел./факс: +7 347 235-60-88, e-mail: [email protected]
2021-2024